很久很久以前，世界还被一片汪洋覆盖，天空贴着水面，蓝得透明纯粹。无数鱼儿在水中游啊游啊，它们是水暗结的精灵，漂亮而神气。水里很安详，鱼儿们一生都在快乐地舞蹈，永远不会失望、惊惧和躲藏。
有一天，天地突然分开，蓝色的天空飞快地飘向远方。陆地凸现，于是出现山川、平原和森林，出现了河流和城市，鱼儿们被纷纷抛出水面，带着无法逃脱的恐慌。
有一条河叫杜甫河，有一座城市叫台北。
阿伟和阿杰是两尾漂亮的鱼，他俩是表兄弟。
阿伟的母亲因癌症早逝，而姐姐阿明也步其后尘，到了癌症晚期，她和男友成哥分手，回到杜甫河边的家中等死。父亲整日无所事事，酗酒成性，奶奶年老，妹妹尚幼。但阿伟是条快乐的鱼，他没有太多的奢望，他有他崇拜的李小龙，他有他的小小梦想，当一名演员。他喜欢坐在台北阴暗的杜甫河边的杂乱小巷中，用画笔描绘他的简单世界。
父母离异表弟阿杰疯狂地迷上了魔术，他希望有朝一日能成为魔术大师，通过他神奇的双手，来改变现实世界。有一次他给姐姐阿明变魔术时，真的变出一匹独角兽，虽然很快被证明那只不过是马戏团跑丢的一匹白马，但他从没怀疑过奇迹迟早会出现。
阿明养了小小的一缸鱼，这是她家小得可怜的存放着梦的地方。阿伟常常在鱼缸前发呆，看着鱼自由地游动。杜甫河，一条肮脏的河，不是鱼儿的天堂！
大哥给了阿伟和阿杰一把枪，叫他们四处去收钱。一次失败的行动中，暴怒的阿杰用枪轰爆了一个大哥的脑袋，从此兄弟俩踏上了不归之路。为了躲避仇家的追杀，他们到成哥家暂住，阿伟发现成哥家里也有同样一个小小的鱼缸，同样的鱼儿在水中游着，如同同一场变得遥远的梦。
姐姐阿明最终被癌症击垮，她拖着疲惫的灵魂走了。阿伟和阿杰勿勿赶回，却被仇家在家门口拦截，慌乱的逃亡中，阿杰惨死在通往家门的巷道。绝望的阿伟要报复，他只身一人来到仇家的住处，在大哥的脑袋上狠击一砖……
然而梦还没完，阿伟在乱棍之下救出阿杰，他们一路奔跑，跑到平时常去的杜甫河上的一座小桥上，在前后堵截之下，兄弟俩最后对望一眼，双双跳入杜甫河中。
张作骥悲悯的目光无法挽救这一切，他三次转过头去，都无法将这个破碎后的梦重新圆上。在肮脏的杜甫河水之中，浑身是伤的兄弟变成了两尾快乐的鱼，在不再透明的水中尽情舞蹈，向梦的深处游去……
